Para salvar a sus hermanos/, Mikey necesita la ayuda del becario de Bishop/, Rod. Pero Rod quiere algo a cambio: que le conviertan en un mutante. Para salvar el día/, Mikey tiene que vovlerse responsable
Dos historias de las tortugas separadas y a la fuga/, las Tortugas Ninja son perseguidas por Bishop y sus Mecazoides. Más adelante tienen que salvar la ciudad de los mutantes marinos conocidos como Los 3 del East River
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